Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnrc6bQ8BKI2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tnrc6bQ8BKI2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.5 ms