Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smarcal1Q8BJL0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Smarcal1Q8BJL0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms