Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe23Q8BGW3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms