Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Vipas39Q8BGQ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Vipas39Q8BGQ1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Vipas39Q8BGQ1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vipas39Q8BGQ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Vipas39Q8BGQ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Vipas39Q8BGQ1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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Vipas39Q8BGQ1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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Vipas39Q8BGQ1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vipas39Q8BGQ1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms