Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG71

Trmt12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt12Q8BG71 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trmt12Q8BG71 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trmt12Q8BG71 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms