Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Katnb1Q8BG40 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Katnb1Q8BG40 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms