Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG27

9930022D16Rik, RIKEN cDNA 9930022D16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930022D16RikQ8BG27 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
9930022D16RikQ8BG27 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
9930022D16RikQ8BG27 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms