Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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