Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg4cQ811C2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Atg4cQ811C2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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Atg4cQ811C2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Atg4cQ811C2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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Atg4cQ811C2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Atg4cQ811C2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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