Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfascQ810U3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms