Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ccdc172Q810N9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms