Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Liat1Q810M6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms