Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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ChfrQ810L3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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ChfrQ810L3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ChfrQ810L3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms