Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Pkhd1l1Q80ZA4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
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