Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lrfn4Q80XU8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lrfn4Q80XU8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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