Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg2bQ80XK6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms