Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Ttc28Q80XJ3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ttc28Q80XJ3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms