Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Abcc12Q80WJ6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Abcc12Q80WJ6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms