Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc155Q80VJ8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc155Q80VJ8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms