Protein–RNA interactions for Protein: Q80V24

Vgll4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll4Q80V24 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vgll4Q80V24 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms