Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Avl9Q80U56 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Avl9Q80U56 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms