Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NischQ80TM9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.5
NischQ80TM9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NischQ80TM9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
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