Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ClmQ7TSN2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ClmQ7TSN2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms