Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dsg1cQ7TSF0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms