Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ckap2lQ7TS74 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ckap2lQ7TS74 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms