Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Actn1Q7TPR4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Actn1Q7TPR4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms