Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD1

Fbxo11, F-box only protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 930 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo11Q7TPD1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fbxo11Q7TPD1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fbxo11Q7TPD1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms