Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Stk40Q7TNL3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Stk40Q7TNL3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms