Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkd1l2Q7TN88 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkd1l2Q7TN88 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms