Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HhipQ7TN16 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HhipQ7TN16 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms