Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SynmQ70IV5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SynmQ70IV5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms