Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sned1Q70E20 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sned1Q70E20 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms