Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Efr3bQ6ZQ18 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Efr3bQ6ZQ18 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms