Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NinlQ6ZQ12 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NinlQ6ZQ12 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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