Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Smpd4Q6ZPR5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Smpd4Q6ZPR5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms