Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Znf653Q6YND2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Znf653Q6YND2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms