Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Slc44a1Q6X893 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Slc44a1Q6X893 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms