Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cxcl3Q6W5C0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cxcl3Q6W5C0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms