Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Opn5Q6VZZ7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms