Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ7

Cd300lf, CMRF35-like molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lfQ6SJQ7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300lfQ6SJQ7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cd300lfQ6SJQ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cd300lfQ6SJQ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms