Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ0

Cd300a, CMRF35-like molecule 8, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300aQ6SJQ0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd300aQ6SJQ0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cd300aQ6SJQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms