Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc57Q6PHN1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc57Q6PHN1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms