Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGL7

Washc2, WASH complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc2Q6PGL7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Washc2Q6PGL7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Washc2Q6PGL7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms