Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc82Q6PG04 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc82Q6PG04 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms