Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gramd2bQ6PEM6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms