Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrm2bQ6PEE3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms