Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE55

Pdgfrl, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrlQ6PE55 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PdgfrlQ6PE55 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PdgfrlQ6PE55 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms