Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE01

Snrnp40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp40Q6PE01 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Snrnp40Q6PE01 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snrnp40Q6PE01 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms