Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc85bQ6PDY0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc85bQ6PDY0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms