Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SvoplQ6PDF3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms